Асоціація агроекологів України ставить за мету своєї діяльності розвиток сучасного екологічного світогляду та інноваційної культури суспільства і повідомляє про створення інтегральної науково-впроваджувальної системи у сфері агроекології (стратегічного інноваційного агроекокластеру).

Головними системоутворюючими складовими такого кластеру будуть інноваційний медіа-центр, фонд екологічних інновацій і технологічний бізнес-інкубатор.